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帝釈堂の右に建つのが祖師堂で、帝釈堂と同じく入母屋造の拝殿と内殿が前後に並んで建つ。昭和２７年および５３年に大改修された。
柴又七福神としては毘沙門天が祀られている。

祖師堂の裏には大客殿が続く。これは外から見たところである。

祖師堂の入口には、経栄山の山号が掲げられている。

この祖師堂が日蓮宗寺院としての本来の本堂であり、本尊は大曼荼羅である。

境内の右手の奥にある、帝釈天で最も古い御堂は釈迦堂で、文化・文政期（1800頃）の建造物である。内陣中央に白鳳期の釈迦立像を安置し、開祖日栄上人、中興祖日敬上人の木像を祀る。開山堂ともいう。

南大門は、昭和５７年に完成された。